Workflows voor bioinformatica

General info

Date 

mei/juni 2010 

Location

Nijmegen, Laan van Scheut 2

Keywords

WebServices, Workflows, Taverna

Organiser

HAN

Teacher(s)

Martijn van der Bruggen

Contact(s)

Martijn van der Bruggen

Description

Binnen het biologisch- en medisch onderzoek is er de afgelopen jaren een stortvloed van informatie vrijgekomen. Daarnaast zijn we in staat om steeds complexere berekeningen uit te voeren over deze gegevens. Theoretisch zouden we in staat zijn om biologische- en medische vraagstukken op te lossen op basis van de informatie uit diverse databronnen. Zeker wanneer we dit kunnen combineren met de processen voor dataverwerking over de wereld zou dit ongekende mogelijkheden bieden. De gegevens liggen echter verspreid over de hele wereld en ieder onderzoeksinstituut gebruikt een eigen standaard. Voor de verwerking van data zijn overal eigen processen en algoritmen ontwikkeld, maar ook deze zijn verspreid over de hele wereld en alleen via lastige procedures aanroepbaar.
Binnen de informatica is de laatste jaren een standaard ontwikkeld om data- en procesintegratie eenvoudig plaats te laten vinden. We gebruiken daarvoor webservices die zo standaard zijn dat ze vanuit iedere programmeertaal of tool eenvoudig aan te roepen zijn. Webservices zijn processen die je over het web kunt aanroepen en zijn niet bedoelt om direct aangeroepen te worden door mensen. Machines of programma’s roepen deze processen over het web aan. Hiermee zijn we in staat om data- en processen aan elkaar te koppelen.

The course will be given in Dutch.