Chris Evelo, PhD

Afdeling Bioinformatica – BiGCaT
Universiteit Maastricht
www.bigcat.unimaas.nl
Groepsgrootte: 10-15

1. Wat is het leidende onderzoeksthema in uw groep?
   “Experimentele data omzetten in biologie door data-integratie en combinatie met bestaande kennis. Er zijn twee soorten data: experimentele data en bestaande kennis. In essentie gaat ons werk over deze vraagstelling: Wat meten we? Hoe gaan we om met de resulterende data? Kunnen we deze data begrijpen in de context van wat we al weten? En wat weten we precies al?
   De biologische context van ons werk heeft voornamelijk betrekking op nutrigenomics, cardiovasculaire aandoeningen en netwerkbenaderingen bij kanker.”
2. Met wat voor soort groepen of organisaties werkt u het meest samen en waarom?
   “Onze brede scope betekent dat we samenwerken met allerlei soorten onderzoeksgroepen: wet-labs die werken aan een biologisch probleem, bioinformaticagroepen zoals wij en kennisintegratiegroepen die werken aan methoden om bestaande kennis te verwerken en te gebruiken.”
3. Wat zijn vanuit jouw onderzoeksperspectief de grootste uitdagingen in de bioinformatica op dit moment?
   “Ik zie er twee. De eerste is de noodzaak om meer te begrijpen over de effecten van genetische variatie en om variatie te integreren in systeembiologische benaderingen. De tweede is dat het semantische web zichzelf moet bewijzen. Het semantische web is veelbelovend, maar de tijd is gekomen om het te laten werken op echte problemen. Dat zal niet gemakkelijk zijn, omdat het een hoog niveau van detail in kennis vereist en we veel impliciete kennis expliciet moeten maken. Een groot obstakel hierbij is de moeilijke communicatie tussen de mensen die het semantische web bouwen en de biologen die de kennis moeten leveren.”
4. Wat is de belangrijkste taak van een groepsleider?
   “Het aanpakken van de bovengenoemde communicatieproblemen, zowel binnen de groep als met externe partijen. Ik fungeer vooral als tolk.”
5. Hoe zou je de sfeer in je groep omschrijven?
   “Open. In discussies, maar ook in termen van open source, open data, samenwerkingen met anderen. Minder positief is dat we door enkele vacatures de groeiende druk voelen om meer te doen met minder mensen en dat beïnvloedt de sfeer af en toe.”

Tekst Esther Thole.