Optimalisatietechnieken in bio-informatica en systeembiologie

17 mei – 21 mei 2010

Uitgebreid cursusprogramma

Maandag 17 mei

INLEIDING EN BASISKENNIS

10:00 – 13:00 Fundamenten van optimalisatie: matrixalgebra en andere wiskundige onderwerpen (AvK)

13:00 – 14:00 Lunch

14:00 – 15:00 Lezen van papers in groepen

15:00 – 16:00 Presentaties van papers en oppositie

16:00 – 17:30 Inleiding univariate optimalisatie (AvK)

Dinsdag 18 mei

LOKALE OPTIMALISATIE

10:00 – 13:00 Lokale optimalisatietechnieken: Simplexmethode, steilste afdaling, geconjugeerde gradiënt (AvK)

13:00 – 14:00 Lunch

14:00 – 15:00 Paper reading in groepen

15:00 – 16:00 Paper presentaties en oppositie

16:00 – 17:30 Computerpracticum: Simplex (Nelder-Mead) en gerelateerde technieken (TB)

Woensdag 19 mei

STOCHASTIC OPTIMISATION

10:00 – 13:00 Stochastische optimalisatietechnieken: Monte Carlo, Simulated Annealing, Particle Swarm Optimisation (JK)

13:00 – 14:00 Lunch

14:00 – 15:00 Paper reading in groepen

15:00 – 16:00 Paper presentaties en oppositie

16:00 – 17:30 Computerpracticum: Simulated annealing en Particle Swarm Optimisation (TB)

Donderdag 20 mei

GLOBALE OPTIMALISATIE

10:00 – 13:00 Globale optimalisatietechnieken: Genetisch algoritme, dynamische programmering, verwachtingsmaximalisatie (JK en JH)

13:00 – 14:00 Lunch

14:00 – 15:00 Paper reading in groepen

15:00 – 16:00 Paperpresentaties en oppositie

16:00 – 17:30 Computerpracticum: Genetisch algoritme, dynamische programmering (TB en JH)

Vrijdag 21 mei

TOEPASSING VAN MULTI-OBJECTIEVE OPTIMALISATIE

10:00 – 13:00 Gemengde en hybride technieken: toepassing op genetische netwerken (JK) 13:00 – 14:00 Lunch

14:00 – 15:00 Paper reading in groepen

15:00 – 16:00 Paperpresentaties en oppositie

16:00 – 17:30 Sociale optimalisatie: Drankjes en hapjes