Optimalisatietechnieken in bio-informatica en systeembiologie
17 mei – 21 mei 2010
Uitgebreid cursusprogramma
Maandag 17 mei
INLEIDING EN BASISKENNIS
10:00 – 13:00 Fundamenten van optimalisatie: matrixalgebra en andere wiskundige onderwerpen (AvK)
13:00 – 14:00 Lunch
14:00 – 15:00 Lezen van papers in groepen
15:00 – 16:00 Presentaties van papers en oppositie
16:00 – 17:30 Inleiding univariate optimalisatie (AvK)
Dinsdag 18 mei
LOKALE OPTIMALISATIE
10:00 – 13:00 Lokale optimalisatietechnieken: Simplexmethode, steilste afdaling, geconjugeerde gradiënt (AvK)
13:00 – 14:00 Lunch
14:00 – 15:00 Paper reading in groepen
15:00 – 16:00 Paper presentaties en oppositie
16:00 – 17:30 Computerpracticum: Simplex (Nelder-Mead) en gerelateerde technieken (TB)
Woensdag 19 mei
STOCHASTIC OPTIMISATION
10:00 – 13:00 Stochastische optimalisatietechnieken: Monte Carlo, Simulated Annealing, Particle Swarm Optimisation (JK)
13:00 – 14:00 Lunch
14:00 – 15:00 Paper reading in groepen
15:00 – 16:00 Paper presentaties en oppositie
16:00 – 17:30 Computerpracticum: Simulated annealing en Particle Swarm Optimisation (TB)
Donderdag 20 mei
GLOBALE OPTIMALISATIE
10:00 – 13:00 Globale optimalisatietechnieken: Genetisch algoritme, dynamische programmering, verwachtingsmaximalisatie (JK en JH)
13:00 – 14:00 Lunch
14:00 – 15:00 Paper reading in groepen
15:00 – 16:00 Paperpresentaties en oppositie
16:00 – 17:30 Computerpracticum: Genetisch algoritme, dynamische programmering (TB en JH)
Vrijdag 21 mei
TOEPASSING VAN MULTI-OBJECTIEVE OPTIMALISATIE
10:00 – 13:00 Gemengde en hybride technieken: toepassing op genetische netwerken (JK) 13:00 – 14:00 Lunch
14:00 – 15:00 Paper reading in groepen
15:00 – 16:00 Paperpresentaties en oppositie
16:00 – 17:30 Sociale optimalisatie: Drankjes en hapjes