Het vakgebied moleculaire biologie staat voor de uitdaging om de kloof tussen data en kennis te overbruggen. Het is duidelijk dat de huidige stortvloed aan data niet automatisch leidt tot nieuwe biologische inzichten. Daarom wordt het ontegenzeggelijk duidelijk dat computationele methoden nodig zullen zijn om de biologische principes die ten grondslag liggen aan deze enorme hoeveelheden data samen te voegen.

Tijdens deze HotTopics-bijeenkomst zullen we dieper ingaan op het gebruik van methoden om (gen)regulerende interacties uit grote biomoleculaire datasets te verduidelijken en te voorspellen, met speciale aandacht voor recente nieuwe biomoleculaire datatypen en manieren om deze te integreren. Van bijzonder belang zijn methoden die een modulegebaseerde aanpak gebruiken, d.w.z. samenvatting van data in modules en toepassing van interactie-inferentie tussen en binnen deze modules.

Het doel is om vooruitgang, problemen en uitdagingen van deze methoden te identificeren in de context van recente ontwikkelingen in genomica, proteomica en metabolomica. In een open discussie willen we leren hoe we het beste uit deze computationele technieken kunnen halen voor een beter begrip van biologie.

Trefwoorden: regulerende interactie, netwerken, modules, high-throughput data

Programma 12 juli
12:30 – 12:35 Welkom – Marc van Driel
12:35 – 13:15 Lunch
13:15 – 13:55 Een schaalruimte-weergave van omics-data
Jeroen de Ridder, TU Delft
13:55 – 14:45 Afleiden van transcriptionele modules uit co-expressie
netwerken
Perry Moerland, AMC, Amsterdam
14.45 –15.35 Computationele benaderingen voor conditie-responsieve
moduledetectie
Gunnar Klau, CWI, Amsterdam
15.35 – 16.25 Voorspelling van genregulerende interacties met behulp van
flowcytometrie, ChIP-seq en fosfoproteomics
Theo Knijnenburg, NKI, Amsterdam
16.25 – 16.55 Algemene discussie
16.55 – 17.00 Sluiting

Locatie
Hogeschool Domstad, Koningsbergerstraat 9, 3531 AJ Utrecht
(max. 25 deelnemers) – Google maps
Parkeren is mogelijk op de parkeerplaats van de Jaarbeurs in Utrecht. Probeer niet te parkeren in de buurt van het gebouw, want er is zeer beperkt ruimte.

Over HotTopics
NBIC HotTopics zijn een nieuwe reeks NBIC-bijeenkomsten die wetenschappers samenbrengen om concepten en methoden te bespreken over een hot topic in hun onderzoeksveld. Het moet een platform bieden om in contact te blijven met collega’s in het veld en het delen van nieuwe inzichten, toepassingen en samenwerkingen te bevorderen. Het doel van de bijeenkomst is daarom niet om de nieuwste resultaten van uw eigen werk te presenteren, maar om nieuwe trends en doorbraken in het veld in het algemeen te identificeren.

Vier wetenschappers geven een lezing van 20 minuten, gevolgd door 40 minuten discussie over de belangrijke computationele concepten:

Wat probeert een methode te bereiken?
Welke aannames zijn gedaan?
Hoe verhoudt deze methode zich tot soortgelijke methoden?
Wat zijn de sterke en zwakke punten en valkuilen?
Kunnen we het ook op andere gebieden toepassen?
Wat zijn de beperkingen en uitdagingen voor nieuwe toepassingen en ontwikkelingen?
Flip over, beamer en laptop zijn beschikbaar.

Registratie
Meld u aan voor de bijeenkomst door het registratieformulier in te vullen!

Organiserend Comité
Dr. Jeroen de Ridder – Technische Universiteit Delft
Dr. Marc van Driel – Netherlands Bioinformatics Centre (NBIC)
(telefoon: +31 6 24448612 / +31 24 3613306)