Programma woensdag 20 april
08:30 – 09:00 Registratie met koffie & thee
09:00 – 09:15 Opening door Lodewijk Wessels (nog te bevestigen)
G) Keynote sessie – Europazaal (voorzitter: Lodewijk Wessels)
09:15 – 10:00 Bas van Steensel, Nederlands Kanker Instituut
Chromatine domein organisatie van eukaryotische genomen
H) Parallelle sessie Europazaal (voorzitter: Lodewijk Wessels)
10:00 – 10:20 Felipe Leal Valenin, Wageningen UR
Kwantitatieve modellering van het regulerende netwerk van bloeitijdgenen
10:20 – 10:40 Askar Obulkasim, VU medisch centrum
Stapsgewijze classificatie van kankermonsters met behulp van klinische en moleculaire gegevens
I) Parallelle sessie Aziezaal (voorzitter: nog te bevestigen)
10:00 – 10:20 Martijn Vermaat, Leiden University Medical Centrum
MUTALYZER 2: Verbeterde sequentievariantbeschrijvingen van next generation
sequentiedata en locusspecifieke mutatiedatabases
10:20 – 10:40 Lennart Karssen, Erasmus Medisch Centrum
De GenABEL-suite
J) Sessie Netherlands Society on Biomolecular Modelling (NSBM) – Videzaal
10:00 – 10:40 Voorzitter: Gerry Nicolaes
- Welkom door Gerry A.F. Nicolaes (NSBM)
- Tina Ritschel, CDD Group, CMBI, Radboud UMC, Nijmegen
Extractie van bruikbare bio-isosterevervangingen uit de PDB - Ezgi Karaca, Bijvoet Centrum voor Biomoleculair Onderzoek, Universiteit Utrecht
Een flexibele dockingbenadering met meerdere domeinen om grote conformationele
veranderingen in de modellering van biomoleculaire complexen aan te pakken
10:40 – 11:10 Koffie- en theepauze
Posterpresentaties
K) Parallelle sessie – Europazaal (voorzitter: Lodewijk Wessels)
11:10 – 11:30 Maarten van Iterson, Leids Universitair Medisch Centrum
Een empirische methode voor het vinden van mRNA-doelen van microRNA: verbetering
van sequentiegebaseerde doelvoorspelling met behulp van expressiegegevens
11:30 – 11:50 Anton Feenstra, Vrije Universiteit Amsterdam
Multi-Harmony: functionele specificiteit detecteren in HIV-differentiële
replicatiesnelheden
L) Parallelle sessie – Aziezaal (voorzitter: wordt nog bekendgemaakt)
11:10 – 11:30 Gerard te Meerman, UMC Groningen
Een op Windows gebaseerde suite voor statistische analyse van next generation
sequencing en de toepassing ervan op exoom- en RNA-gegevens
11:30 – 11:50 Kees van Bochove, NBIC
Een democratie van rapportagenormen voor omics-studies
M) Parallelle NSBM-sessie – Videzaal (voorzitter: Gerry Nicolaes)
11:10 – 11:50 – Barbara Zarzycka, Maastricht, Universiteit Maastricht
Proteïne-peptide docking van humane trombine: richting verbeterde beeldvorming bij
hart- en vaatziekten
- Albert Kooistra, Vrije Universiteit Amsterdam
De agonismefactor van ß1 en ß2 adrenerge receptoren
12:00 – 14:00 Lunchbuffet & postersessies
Application Showcase
Posterpresentaties
–
N] Parallelle sessie – Europazaal (voorzitter: Jaap Heringa)
14:00 – 14:20 Marc Hulsman, Technische Universiteit Delft
Ibidas: een op bioinformatica gerichte probleemoplossende omgeving voor
data-exploratie, in verschillende datastructuren en opslagformaten
14:20 – 14:40 Margherita Francescatto, VU medisch centrum
Profilering van transcriptie-initiatie in het verouderde menselijke brein met behulp van deep-CAGE
14:40 – 15:00 Patrick Kemmeren, Universitair Medisch Centrum Utrecht
Eenvoudige netwerkmotieven vormen de basis van het gisttranscriptienetwerk
–
O) Parallelle NSBM-sessie – Videzaal (voorzitter: Gerry Nicolaes)
14:00 – 15:00 – Gert Vriend: Inleiding tot GPCR-modellering
- Luc Roumen, Vrije Universiteit Amsterdam
GPCR-modellering aan de Vrije Universiteit Amsterdam: het succes van
structurele bioinformatica - Marijn Sanders, MSD, Oss & CDD-groep, CMBI, Radboud UMC Nijmegen
Een GPCR-modelleringspijplijn: onbevooroordeeld van lage naar hoge resolutie
Complexe GPCR-modellen
15:00 – 15:30 Koffie- en theepauze
Posterpresentaties
P) Plenaire sessie – Europazaal (voorzitter: Jaap Heringa)
15:30 – 15:40 Irene Nooren, Universiteit van Amsterdam
e-BioGrid: Life-Science Research and Technology mogelijk maken
15:40 – 15:50 Resultaten NBIC Hackathon
15:50 – 16:20 Showcase van de laatste toepassing
16:20 – 16:50 Prijsuitreiking winnaar van de NBIC Young Investigator Award 2011
gevolgd door een lezing door de winnaar Dr. Yang Li
Generalized Genetical Genomics – Geavanceerde methoden en toepassingen
Q) Keynote-sessie – Europazaal (voorzitter: Jaap Heringa)
16:50 – 17:35 Phil Bourne, Department of Pharmacology & Skaggs School
of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences, University of California San Diego
Bioinformatics Meets Systems Biology voor vroege medicijnontdekking
17:35 – 18:00 Bekendmaking van de winnaar van de applicatieshowcase &
Posterprijswinnaar & Beste lezingprijswinnaar &
winnaar van de BIUP Posterprijs
18:00 Afsluiting van de conferentie door Jaap Heringa