Programma woensdag 20 april

08:30 – 09:00 Registratie met koffie & thee

09:00 – 09:15 Opening door Lodewijk Wessels (nog te bevestigen)

G) Keynote sessie – Europazaal (voorzitter: Lodewijk Wessels)

09:15 – 10:00 Bas van Steensel, Nederlands Kanker Instituut
Chromatine domein organisatie van eukaryotische genomen

H) Parallelle sessie Europazaal (voorzitter: Lodewijk Wessels)

10:00 – 10:20 Felipe Leal Valenin, Wageningen UR
Kwantitatieve modellering van het regulerende netwerk van bloeitijdgenen
10:20 – 10:40 Askar Obulkasim, VU medisch centrum
Stapsgewijze classificatie van kankermonsters met behulp van klinische en moleculaire gegevens

I) Parallelle sessie Aziezaal (voorzitter: nog te bevestigen)

10:00 – 10:20 Martijn Vermaat, Leiden University Medical Centrum
MUTALYZER 2: Verbeterde sequentievariantbeschrijvingen van next generation
sequentiedata en locusspecifieke mutatiedatabases
10:20 – 10:40 Lennart Karssen, Erasmus Medisch Centrum
De GenABEL-suite

J) Sessie Netherlands Society on Biomolecular Modelling (NSBM) – Videzaal

10:00 – 10:40 Voorzitter: Gerry Nicolaes

  • Welkom door Gerry A.F. Nicolaes (NSBM)
  • Tina Ritschel, CDD Group, CMBI, Radboud UMC, Nijmegen
    Extractie van bruikbare bio-isosterevervangingen uit de PDB
  • Ezgi Karaca, Bijvoet Centrum voor Biomoleculair Onderzoek, Universiteit Utrecht
    Een flexibele dockingbenadering met meerdere domeinen om grote conformationele
    veranderingen in de modellering van biomoleculaire complexen aan te pakken

10:40 – 11:10 Koffie- en theepauze
Posterpresentaties

K) Parallelle sessie – Europazaal (voorzitter: Lodewijk Wessels)

11:10 – 11:30 Maarten van Iterson, Leids Universitair Medisch Centrum
Een empirische methode voor het vinden van mRNA-doelen van microRNA: verbetering
van sequentiegebaseerde doelvoorspelling met behulp van expressiegegevens
11:30 – 11:50 Anton Feenstra, Vrije Universiteit Amsterdam
Multi-Harmony: functionele specificiteit detecteren in HIV-differentiële
replicatiesnelheden

L) Parallelle sessie – Aziezaal (voorzitter: wordt nog bekendgemaakt)

11:10 – 11:30 Gerard te Meerman, UMC Groningen
Een op Windows gebaseerde suite voor statistische analyse van next generation
sequencing en de toepassing ervan op exoom- en RNA-gegevens
11:30 – 11:50 Kees van Bochove, NBIC
Een democratie van rapportagenormen voor omics-studies

M) Parallelle NSBM-sessie – Videzaal (voorzitter: Gerry Nicolaes)

11:10 – 11:50 – Barbara Zarzycka, Maastricht, Universiteit Maastricht
Proteïne-peptide docking van humane trombine: richting verbeterde beeldvorming bij
hart- en vaatziekten

  • Albert Kooistra, Vrije Universiteit Amsterdam
    De agonismefactor van ß1 en ß2 adrenerge receptoren

12:00 – 14:00 Lunchbuffet & postersessies
Application Showcase
Posterpresentaties


N] Parallelle sessie – Europazaal (voorzitter: Jaap Heringa)

14:00 – 14:20 Marc Hulsman, Technische Universiteit Delft
Ibidas: een op bioinformatica gerichte probleemoplossende omgeving voor
data-exploratie, in verschillende datastructuren en opslagformaten
14:20 – 14:40 Margherita Francescatto, VU medisch centrum
Profilering van transcriptie-initiatie in het verouderde menselijke brein met behulp van deep-CAGE
14:40 – 15:00 Patrick Kemmeren, Universitair Medisch Centrum Utrecht
Eenvoudige netwerkmotieven vormen de basis van het gisttranscriptienetwerk


O) Parallelle NSBM-sessie – Videzaal (voorzitter: Gerry Nicolaes)

14:00 – 15:00 – Gert Vriend: Inleiding tot GPCR-modellering

  • Luc Roumen, Vrije Universiteit Amsterdam
    GPCR-modellering aan de Vrije Universiteit Amsterdam: het succes van
    structurele bioinformatica
  • Marijn Sanders, MSD, Oss & CDD-groep, CMBI, Radboud UMC Nijmegen
    Een GPCR-modelleringspijplijn: onbevooroordeeld van lage naar hoge resolutie
    Complexe GPCR-modellen

15:00 – 15:30 Koffie- en theepauze
Posterpresentaties

P) Plenaire sessie – Europazaal (voorzitter: Jaap Heringa)

15:30 – 15:40 Irene Nooren, Universiteit van Amsterdam
e-BioGrid: Life-Science Research and Technology mogelijk maken
15:40 – 15:50 Resultaten NBIC Hackathon

15:50 – 16:20 Showcase van de laatste toepassing

16:20 – 16:50 Prijsuitreiking winnaar van de NBIC Young Investigator Award 2011
gevolgd door een lezing door de winnaar Dr. Yang Li
Generalized Genetical Genomics – Geavanceerde methoden en toepassingen

Q) Keynote-sessie – Europazaal (voorzitter: Jaap Heringa)

16:50 – 17:35 Phil Bourne, Department of Pharmacology & Skaggs School
of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences, University of California San Diego
Bioinformatics Meets Systems Biology voor vroege medicijnontdekking

17:35 – 18:00 Bekendmaking van de winnaar van de applicatieshowcase &
Posterprijswinnaar & Beste lezingprijswinnaar &
winnaar van de BIUP Posterprijs

18:00 Afsluiting van de conferentie door Jaap Heringa