Hieronder vindt u het voorlopige conferentieprogramma voor 25 april
08:30 – 09:00 Registratie met koffie & thee
09:00 – 09:05 Opening door Marcel Reinders (wetenschappelijk directeur NBIC)

I) Keynote-sessie – Europazaal (voorzitter: Marcel Reinders)

09:05 – 09:50 Keynote: Prof. Gerard J. Kleywegt, Protein Data Bank in Europe (PDBe),
EMBL-EBI, “Just because it’s in Nature, doesn’t mean it’s true…”

J) Parallelsessie: Networks – Amerika zaal (voorzitter: Perry Moerland)

9:50 – 10:10 Chris Oates, Nederlands Kankerinstituut
Network Inference Using Chemical Kinetics
10:10 – 10:30 Mohammed El-Kebir, Vrije Universiteit Amsterdam & CWI
NatalieWEB: Een webserver voor topologiebewuste globale eiwit-eiwit
interactienetwerkvergelijking

K] Parallelsessie: Groei – Azie zaal (voorzitter: Dick de Ridder)

9:50 – 10:10 Philip Lijnzaad, Molecular Cancer Research, UMC Utrecht
Using Singular Value Decomposition to extricate population effects
in perturbation studies of yeast.
10:10 – 10:30 Aldert Zomer, Radboud UMC Nijmegen
Detectie van genen die essentieel zijn voor de groei van luchtwegpathogenen

L) Parallelsessie: Infrastructure & Support (DISC) – Zaal 5

09:50 – 10:03 Irene Nooren, Universiteit van Amsterdam
e-BioGrid: Bouwen aan een Nederlandse e-science infrastructuur voor life science onderzoek.
10:03 – 10:16 Gera Pronk, SURFnet
NBIC als IDP – wat betekent het voor u?
10:16 – 10:30 Jan Bot, Universiteit Leiden
BiG Grid-infrastructuur: Faciliteren van de computationele behoeften voor huidige
bioinformatica-toepassingen

M) NSBM Spring Meeting – Vide 1+2 (voorzitter: Gerry Nicolaes)

09:50 – 10:10 Anton Feenstra, Vrije Universiteit Amsterdam
Snelle en nauwkeurige berekening van eiwit-eiwitinteractie: bijdrage
van oppervlakte- en interfaceresiduen
10:10 – 10:30 Rob van der Kant, CMBI, UMC St Radboud Nijmegen
GPCR-activering: Wat beweegt waar?

N) NL Biolmaging AM Side Meeting – Zaal 3 (voorzitter: Dorus Gadella)

09:50 – 10:10 Thomas Schmidt, Physics of Life Processes, Cell Observatory,
Universiteit Leiden
Partitionering van HRas bestudeerd door superresolutie-imaging.
10:10 – 10:30 Mark Hink, van Leeuwenhoek Centre for Advanced Microscopy, SILS,
Universiteit van Amsterdam
Kwantitatieve live-cell microscopie met behulp van nieuw ontwikkelde fluorescerende
eiwitten in fluorescentie fluctuatie spectroscopie.

10:30 – 11:30 Koffie- en theepauze

• Postersessie (even nummers) – Europazaal
• Toepassingsshowcase – Entreehal
• Marktplaats

0) Parallelsessie: Metabolisme – Amerika zaal (voorzitter: Hans van Beek)

11:30 – 11:50 Konrad Zych, Groningen Bioinformatics Centre, Rijksuniversiteit Groningen
Computationele analyse van de modulaire architectuur van secundaire
metabolietbiosynthesegenclusters
11:50 – 12:10 Hannes Hettling, Vrije Universiteit Amsterdam
Computationele schatting van tricarbonzuurcyclusfluxen
in het hart uit ruisige NMR-gegevens

P) Parallelsessie: Transcriptionele regulatie – Azië zaal (voorzitter: Bas Teusink)

11:30 – 11:50 Christof Francke, Radboud UMC / TI Food & Nutrition
Het gebruik van vergelijkende genomica om de geconserveerde biologische
rol van transcriptie te onthullen regulatoren
11:50 – 12:10 Jose M Muino, Wageningen UR
Verder kijken dan de CArG-box: inzicht in de temperatuurafhankelijke
DNA-binding van MADS-domeintranscriptiefactoren

Q) Parallelsessie: Infrastructure & Support (DISC) – Zaal 5

11:30 – 11:43 Jildau Bouwman, TNO
Gestructureerde data-analyse en -opslag om systeembiologische analyse te vergemakkelijken.
11:43 – 11:56 Eleni Mina, Leids Universitair Medisch Centrum
e-Science in bioinformatica: hergebruik van methoden mogelijk maken en tegelijkertijd de
epigenetische factoren van de ziekte van Huntington ontrafelen.
11:56 – 12:10 Egon Willighagen, Universiteit Maastricht
Bijdragen aan de Chemistry Development Kit voor metabolomics en
medicijnontdekking: twaalf jaar Nederlandse betrokkenheid bij de Open Source
cheminformatics-bibliotheek.

R) NSBM Spring Meeting – Vide 1+2 (voorzitter: Gerry Nicolaes)

11:30 – 11:50 Hein Wijma, Rijksuniversiteit Groningen
Combinatie van computationeel ontwerp en gerichte evolutie als
strategie om enzymen drastisch te stabiliseren
11:50 – 12:10 Bastiaan van den Berg, Technische Universiteit Delft
Een enzymherontwerpmethode voor verbeterde productiesnelheden in
Aspergillus niger

S) NL Biolmaging AM Side Meeting – Zaal 3 (voorzitter: Dorus Gadella)
11:30-11:50 Jack Fransen, Microscopic Imaging Centre, NCMLS, Radboud UMC
High-content microscopy van cytotoxische T-cel effectorfunctie in
migratie-afhankelijke organotypische kweektest.
11:50-12:10 Daniël Lam, Afdeling Moleculaire Celbiologie, Sanquin Research.
SETting the stage: Beeldanalyse in celbiologie.

12:10 – 13:50 Lunchbuffet Marktplaats: ontmoetingspunt BIUP, stands T) Parallelsessie: Regulation – Amerika zaal (voorzitter: Berend Snel) 13:50 – 14:10 Evert Bosdriesz, Vrije Universiteit Amsterdam Optimale en robuuste regulatie van genexpressie 14:10 – 14:30 Wilco Fleuren, CMBI/CDD, Radboud UMC, Nijmegen Onderzoek naar mechanismen van door prednisolon geïnduceerde metabolische bijwerking

in vetweefsel. 14:30 – 14:50 Marnix Medema, Rijksuniversiteit Groningen
Computationele genomica en synthetische biologie implementatie
van microbiële secundaire metabolietbiosynthesepaden

U) Parallelle sessie: NGS-variatiedetectie – Azië zaal (voorzitter: Kai Ye)

13:50 – 14:10 Joep de Ligt, Radboud UMC, Nijmegen
Identificatie van nieuwe genen voor verstandelijke beperkingen door
detectie van de novo-mutaties
14:10 – 14:30 Yanju Zhang, Leids Universitair Medisch Centrum
PASSion: een op patroongroeialgoritmen gebaseerde pijplijn voor
splice-junctiedetectie in gepaarde-eind RNA-seq-gegevens
14:30 – 14:50 Eric-Wubbo Lameijer, Leids Universitair Medisch Centrum
Pindel 2: detectie van inserties, deleties, inversies en tandem
duplicaties in next-generation sequencing-gegevens

V) NSBM Voorjaarsbijeenkomst – Vide 1+2 (voorzitter: Gerry Nicolaes)

13:50 – 14:50 Prof Gerard J. Kleywegt, Protein Data Bank in Europe (PDBe),
EMBL-EBI

W) NL Biolmaging AM Side Meeting – Zaal 3 (voorzitter: Dorus Gadella)

13:50-14:10 Farzad Fereidouni, afdeling Moleculaire Biofysica, Debye Instituut,
Universiteit Utrecht
Spectrale fasoranalyse maakt snelle en betrouwbare ontmenging van
fluorescentiemicroscopiespectraalbeelden mogelijk.
14:10-14:30 Ulrike Schnell, afdeling Celbiologie, Universitair Medisch Centrum Groningen
Immunolabelingartefacten en de noodzaak van live-cell imaging.
14:30-14:50 Werner Koopman, afdeling Biochemie, NCMLS, Radboud UMC
Naar een systeembiologisch begrip van mitochondriale structuur
en functie in gezondheid en ziekte.

14:50 – 15:50 Koffie- en theepauze

• Postersessie (oneven nummers)
• Toepassingsshowcase
• Marktplaats

X) Plenaire sessie – Europazaal (voorzitter Marcel Reinders)

15:50 – 16:20 Lezing Jaap Heringa, wetenschappelijk directeur NBIC
“BioWise: Wising up to bioinformatics education”

16:20 – 16:50 Uitreiking van de NBIC Young Investigator Award 2012

Y) Keynote-sessie – Europazaal

16:50 – 17:35 Keynote: Keynote: Dorus Gadella, SILS, Universiteit van Amsterdam.
De microscopie- en bioimagingrevolutie: zien is geloven.

Z) Plenaire sessie – Europazaal (voorzitter: Marcel Reinders)

17:35 – 18:05 Prijsuitreiking:

• NBIC Poster Award
• BioWise Student Poster Prize
• Application Showcase Award
• Prijs voor beste lezing

18:05 Afsluiting van de conferentie
Ga naar programma 24 april
Ga naar hoofdpagina programma